内蒙古地区不同地理种群布氏田鼠遗传分化研究

时间:2022-10-19 17:18:03 公文范文 来源:网友投稿

摘要 [目的]探讨布氏田鼠地理种群的遗传分化。[方法]以MHCⅡ类基因第二外显子为分子标记进行序列分析和基因分型。结果:获得了内蒙古8个布氏田鼠地理种群460个样品的MHCⅡ类基因第二外显子基因的261 bp核苷酸序列,经单倍型分选后,共定义了21个单倍型,其中有3个单倍型为不同区域种群所共享,其余19个单倍型均为各区域种群所特有。单倍型网络进化关系分析显示,8个布氏田鼠地理种群形成3个稳定的进化支,分别与采集的地理种群相吻合:同一地理种群内单倍型之间遗传差异小,而不同地理来源的单倍型之间存在较大区别。AMOVA分析显示,遗传变异主要发生在区域类群间。对基因流和遗传分化系数、种群遗传距离和遗传相似度分析表明,布氏田鼠种群出现了一定的遗传分化,正镶白旗种群因浑善达克沙漠的阻碍而分化最明显。Mentel检测揭示布氏田鼠的遗传分化与地理距离无显著相关性。[结论]栖息地的复杂地形和气候变化可能是影响布氏田鼠群体间遗传分化的主要因素,而种群间距离隔离对于布氏田鼠的遗传分化作用不明显。

关键词 布氏田鼠;地理种群;MHCⅡ类基因;遗传分化;内蒙古

中图分类号 Q958.1 文献标识码 A 文章编号 1007-5739(2017)16-0220-04

Abstract [Objective]Explore the genetic differentiation of geographical populations of Lasiopodomys brandtii.[Methods]Sequences were analyzed based on MHC Class Ⅱ gene exon 2.[Results]261 bp nucleotide sequences of MHC ClassⅡexon 2 from 460 individuals of 8 L.brandtii populations were analyzed by the methods of polymerase chain reaction and direct sequencing. Result showed that 21 genotypes were detected from 460 individuals of 8 L.brandtii geo-populations in Inner Mongolia.Median-joining network grouped 21 haplotypes into three distinct clades,which corresponded to three geographic areas,indicating an obvious phylogeographic pattern. AMOVA showed that most of the genetic variation occurred among geographic groups.The analysis results of gene flow and F-Statistics,genetic similarity and genetic distance indicated that that genetic differentiation already occurred among geographic groups,Zhengxiangbaiqi population was separated geographically from all others,indicating that Hunshandake Sandy Land might make an effective barrier against gene flow.The result of Mantel test illustrated that there were no significant correlations between genetic distance and geographic distance.[Conclusions]Complex topographic configuration and climatic changes of habitat played the most important role and geographic distance was not significant in the genetic differentiation of L.brandtii populations.

Key words Lasiopodomys brandtii;geo-populations;MHC ClassⅡgene;genetic differentiation;Inner Mongolia

種群遗传学认为地理特征(地形障碍、空间距离等)或者历史事件(栖息地片段化、冰期隔离、种群扩张等)是限制基因流的重要因素,会影响种群遗传结构的形成过程,引起种群间的遗传分化[1-2]。

内蒙古自治区地形地貌复杂。在其中部地区、东部地区分布着毛乌素沙地、浑善达克沙地、乌珠穆沁沙地、科尔沁沙地、呼伦贝尔沙地,且气候多变,具有降水量少而不匀、寒暑变化剧烈的显著特点。本区分布的物种遗传结构受到了复杂的地质历史和地理特征的影响[3]。

布氏田鼠(Lasiopodomys brandtii)属啮齿目(Rodentia)仓鼠科(Cricetidae)田鼠亚科(Microtinae),为内蒙古草原代表性小型哺乳动物,是危害草原和鼠疫传播的宿主。种群成呈点状、片段化、间断性分布于内蒙古中部地区、东部地区,因其扩散能力弱,对栖息地环境有很强的依赖性,因而是研究复杂生境中环境压力对种群遗传影响的典型生物物种[4-6]。由于布氏田鼠长期受特定的地理环境条件胁迫和栖息地片段化的双重作用,有可能导致种群在分子水平上的差异而分化为不同的适应性种群,对草原的保护和疫病防治产生重要影响。Wang等[7]基于微卫星标记对内蒙古4个布氏田鼠地理种群遗传结构分析表明,受草原荒漠化的影响,种群内近交现象严重,基因流呈现海岛模式,正镶白旗种群与其他种群出现分化。

推荐访问:田鼠 种群 内蒙古 分化 遗传